Desde janeiro de 2016, o Hospital Montenegro 100% SUS aderiu ao Programa Nacional de Gestão de Custos (PNGC), o programa do Ministério da Saúde, é destinado aos gestores das Unidades de Saúde e do Sistema Único de Saúde (SUS).

Surgiu perante a necessidade de se conhecer os custos dos produtos e serviços, e com isso apurar, avaliar e aprimorar a gestão de custos e dessa forma, auxiliar as Instituições assistenciais quanto à aplicação dos recurso da Saúde.